中國領銜全球**大植物基因測序 水稻育種由手工篩選走向精準設計

　　迄今全球**大植物基因測序項目“3000份水稻基因組研究”26日結出碩果——北京時間當天凌晨1點，國際****學術期刊《自然》正式發(fā)表《3010份亞洲栽培稻基因組研究》；由中國主導的此項國際間科研大協(xié)作，針對水稻起源、分類和馴化規(guī)律進行了深入探討，揭示了亞洲栽培稻的起源和群體基因組變異結構，剖析了水稻核心種質資源的基因組遺傳多樣性。這一重大成果將推動水稻規(guī)模化基因發(fā)掘和水稻復雜性狀分子改良，提升全球水稻基因組研究和分子育種水平，使水稻育種由傳統(tǒng)的手工篩選走向基于大數據的精準設計。

　　該項目首席科學家、中國農科院作科所研究員黎志康表示，過去和未來的育種成果都取決于我們對種質資源遺傳多樣性的利用；全球一共保留了78萬份水稻種質資源，弄清核心種質資源的基因組的多樣性，包括所有基因的等位基因及其各種各樣的變異，能夠為未來的水稻品種改良建立永久的、基于水稻功能基因組信息的數據庫和應用平臺。

　　他介紹，項目經嚴格的分層取樣法，選取源于全球89個國家的3010份水稻種質，代表了78萬份中95%以上的遺傳多樣性。研究發(fā)現了

　　2900萬份新的SNPs(單核苷酸多態(tài)性)，相當于在水稻基因組中加進了2900萬個標簽，給基因育種提供了精確導向；恢復了秈稻、粳稻的命名；完成了對栽培稻**精細的種群分類：九個群體，包括4個秈稻亞群、3個粳稻亞群及Aus、Aro；發(fā)現了豐富的基因組結構變異，包括易位、倒位、重復和缺失；確定了全球首個近于完整的、高質量的農作物-亞洲栽培稻的泛基因組。

　　國際水稻研究所首席科學家，國際水稻基因庫主任R·S·漢密爾頓博士評價說，“過去從一個性狀發(fā)現到品種育成需要近40年，現在利用這些信息短短幾年就可以實現”。此外，該項研究還可以使育種過程更加高效和精確，使育成品種減少對環(huán)境的影響，低投入高產出，以及適應消費者不斷變化的需求。

　　該項研究由中國農科院作科所牽頭，聯(lián)合國際水稻研究所、華大基因、上海交大、深圳農業(yè)基因所、安徽農大、美國亞利桑那大學等16家機構共同完成，并得到中國科技部、農業(yè)農村部、國家自然基金委及美國蓋茨基金會支持。